解決済みなのに、後入りしてすみません(^^)
うちでも苦しんできたテーマですので...。
すべてプリプロセスは、軽いデータ以外、ほぼ成功しないので、面倒ですがサブツールを一つずつプリプロセスしています。
あと、サブツールが重すぎてデシメーションできない場合(異常に時間がかかってあきらめてしまう)一度90%などで軽くかけて、それから改めて20%などの目標値までかけなおすとうまくいく感じがします。
あまりに重い場合は、2度掛け、3度掛けすることもありますが、プリント後の劣化はあまり感じません。