@mofu-2sann
動画も拝見しました。
考えうるパターンとしてはスケール設定がおかしいため、座標系が書き出し時に狂ってしまうパターンというのがあります。
表示のおかしさを鑑みるにどちらかが発生していてもおかしくはないと思います。
1.元のモデルが非常に大きいのに対して、書き出し時のサイズが非常に小さい場合。
2.元のモデルが非常に小さいのに対して、書き出し時の倍率が非常に大きい場合。
まずはこの動画の手順に従って、モデル全体を表示→バウンディングボックスを配置→ユニファイ→欲しいスケールを指定してすべてのサブツールに反映→ユニファイ
とやった後、ZBrushからSTLで書き出ししてみて様子を見てください。
また、ツール>ジオメトリ>サイズの数値と、ツール>エクスポートの"スケール"の数値をスクショで掲載していただけると幸いです。
もしそれでも解決しない場合には、データを添えて公式サポートにお問い合わせしたほうが良いと思います。